UM  > 健康科學學院
A Pan-Cancer Analysis Reveals High-Frequency Genetic Alterations in Mediators of Signaling by the TGF-β Superfamily
Korkut A.1; Zaidi S.13; Kanchi R.S.1; Rao S.13; Gough N.R.13; Schultz A.1; Li X.1; Lorenzi P.L.1; Berger A.C.5; Robertson G.12; Kwong L.N.1; Datto M.2; Roszik J.1; Ling S.1; Ravikumar V.1; Manyam G.1; Rao A.1; Shelley S.11; Liu Y.1; Ju Z.1; Hansel D.9; de Velasco G.15; Pennathur A.14; Andersen J.B.16; O'Rourke C.J.16; Ohshiro K.13; Jogunoori W.13; Nguyen B.-N.13; Li S.1; Osmanbeyoglu H.U.10; Ajani J.A.1; Mani S.A.1; Houseman A.17; Wiznerowicz M.8; Chen J.1; Gu S.13; Ma W.1; Zhang J.1; Tong P.1; Cherniack A.D.5; Deng C.13; Resar L.19; Caesar-Johnson S.J.; Demchok J.A.; Felau I.; Kasapi M.; Ferguson M.L.; Hutter C.M.; Sofia H.J.; Tarnuzzer R.; Wang Z.; Yang L.; Zenklusen J.C.; Zhang J.J.; Chudamani S.; Liu J.; Lolla L.; Naresh R.; Pihl T.; Sun Q.; Wan Y.; Wu Y.; Cho J.; DeFreitas T.; Frazer S.; Gehlenborg N.; Getz G.; Heiman D.I.; Kim J.; Lawrence M.S.; Lin P.; Meier S.; Noble M.S.; Saksena G.; Voet D.; Zhang H.; Bernard B.; Chambwe N.; Dhankani V.; Knijnenburg T.; Kramer R.; Leinonen K.; Liu Y.; Miller M.; Reynolds S.; Shmulevich I.; Thorsson V.; Zhang W.; Akbani R.; Broom B.M.; Hegde A.M.; Ju Z.; Kanchi R.S.; Korkut A.; Li J.; Liang H.; Ling S.; Liu W.; Lu Y.; Mills G.B.; Ng K.-S.; Rao A.; Ryan M.; Wang J.; Weinstein J.N.; Zhang J.; Abeshouse A.; Armenia J.; Chakravarty D.; Chatila W.K.; de Bruijn I.; Gao J.; Gross B.E.; Heins Z.J.; Kundra R.; La K.; Ladanyi M.; Luna A.; Nissan M.G.; Ochoa A.; Phillips S.M.; Reznik E.; Sanchez-Vega F.; Sander C.; Schultz N.; Sheridan R.; Sumer S.O.; Sun Y.; Taylor B.S.; Wang J.; Zhang H.; Anur P.; Peto M.; Spellman P.; Benz C.; Stuart J.M.; Wong C.K.; Yau C.; Hayes D.N.; Parker J.S.; Wilkerson M.D.; Ally A.; Balasundaram M.; Bowlby R.; Brooks D.; Carlsen R.; Chuah E.; Dhalla N.; Holt R.; Jones S.J.M.; Kasaian K.; Lee D.; Ma Y.; Marra M.A.; Mayo M.; Moore R.A.; Mungall A.J.; Mungall K.; Robertson A.G.; Sadeghi S.; Schein J.E.; Sipahimalani P.; Tam A.; Thiessen N.; Tse K.; Wong T.; Berger A.C.; Beroukhim R.; Cherniack A.D.; Cibulskis C.; Gabriel S.B.; Gao G.F.; Ha G.; Meyerson M.; Schumacher S.E.; Shih J.; Kucherlapati M.H.; Kucherlapati R.S.; Baylin S.; Cope L.; Danilova L.; Bootwalla M.S.; Lai P.H.; Maglinte D.T.; Van Den Berg D.J.; Weisenberger D.J.; Auman J.T.; Balu S.; Bodenheimer T.; Fan C.; Hoadley K.A.; Hoyle A.P.; Jefferys S.R.; Jones C.D.; Meng S.; Mieczkowski P.A.; Mose L.E.; Perou A.H.; Perou C.M.; Roach J.; Shi Y.; Simons J.V.; Skelly T.; Soloway M.G.; Tan D.; Veluvolu U.; Fan H.; Hinoue T.; Laird P.W.; Shen H.; Zhou W.; Bellair M.; Chang K.; Covington K.; Creighton C.J.; Dinh H.; Doddapaneni H.; Donehower L.A.; Drummond J.; Gibbs R.A.; Glenn R.; Hale W.; Han Y.; Hu J.; Korchina V.; Lee S.; Lewis L.; Li W.; Liu X.; Morgan M.; Morton D.; Muzny D.; Santibanez J.; Sheth M.; Shinbrot E.; Wang L.; Wang M.; Wheeler D.A.; Xi L.; Zhao F.; Hess J.; Appelbaum E.L.; Bailey M.; Cordes M.G.; Ding L.; Fronick C.C.; Fulton L.A.; Fulton R.S.; Kandoth C.; Mardis E.R.; McLellan M.D.; Miller C.A.; Schmidt H.K.; Wilson R.K.; Crain D.; Curley E.; Gardner J.; Lau K.; Mallery D.; Morris S.; Paulauskis J.; Penny R.; Shelton C.; Shelton T.; Sherman M.; Thompson E.; Yena P.; Bowen J.; Gastier-Foster J.M.; Gerken M.; Leraas K.M.; Lichtenberg T.M.; Ramirez N.C.; Wise L.; Zmuda E.; Corcoran N.; Costello T.; Hovens C.; Carvalho A.L.; de Carvalho A.C.; Fregnani J.H.; Longatto-Filho A.; Reis R.M.; Scapulatempo-Neto C.; Silveira H.C.S.; Vidal D.O.; Burnette A.; Eschbacher J.; Hermes B.; Noss A.; Singh R.; Anderson M.L.; Castro P.D.; Ittmann M.; Huntsman D.; Kohl B.; Le X.; Thorp R.; Andry C.; Duffy E.R.; Lyadov V.; Paklina O.; Setdikova G.; Shabunin A.; Tavobilov M.; McPherson C.; Warnick R.; Berkowitz R.; Cramer D.; Feltmate C.; Horowitz N.; Kibel A.; Muto M.; Raut C.P.; Malykh A.; Barnholtz-Sloan J.S.; Barrett W.; Devine K.; Fulop J.; Ostrom Q.T.; Shimmel K.; Wolinsky Y.; Sloan A.E.; De Rose A.; Giuliante F.; Goodman M.; Karlan B.Y.; Hagedorn C.H.; Eckman J.; Harr J.; Myers J.; Tucker K.; Zach L.A.; Deyarmin B.; Hu H.; Kvecher L.; Larson C.; Mural R.J.; Somiari S.; Vicha A.; Zelinka T.; Bennett J.; Iacocca M.; Rabeno B.; Swanson P.; Latour M.; Lacombe L.; Tetu B.; Bergeron A.; McGraw M.; Staugaitis S.M.; Chabot J.; Hibshoosh H.; Sepulveda A.; Su T.; Wang T.; Potapova O.; Voronina O.; Desjardins L.; Mariani O.; Roman-Roman S.; Sastre X.; Stern M.-H.; Cheng F.; Signoretti S.; Berchuck A.; Bigner D.; Lipp E.; Marks J.; McCall S.; McLendon R.; Secord A.; Sharp A.; Behera M.; Brat D.J.; Chen A.; Delman K.; Force S.; Khuri F.; Magliocca K.; Maithel S.; Olson J.J.; Owonikoko T.; Pickens A.; Ramalingam S.; Shin D.M.; Sica G.; Van Meir E.G.; Zhang H.; Eijckenboom W.; Gillis A.; Korpershoek E.; Looijenga L.; Oosterhuis W.; Stoop H.; van Kessel K.E.; Zwarthoff E.C.; Calatozzolo C.; Cuppini L.; Cuzzubbo S.; DiMeco F.; Finocchiaro G.; Mattei L.; Perin A.; Pollo B.; Chen C.; Houck J.; Lohavanichbutr P.; Hartmann A.; Stoehr C.; Stoehr R.; Taubert H.; Wach S.; Wullich B.; Kycler W.; Murawa D.; Wiznerowicz M.; Chung K.; Edenfield W.J.; Martin J.; Baudin E.; Bubley G.; Bueno R.; De Rienzo A.; Richards W.G.; Kalkanis S.; Mikkelsen T.; Noushmehr H.; Scarpace L.; Girard N.; Aymerich M.; Campo E.; Gine E.; Guillermo A.L.; Van Bang N.; Hanh P.T.; Phu B.D.; Tang Y.; Colman H.; Evason K.; Dottino P.R.; Martignetti J.A.; Gabra H.; Juhl H.; Akeredolu T.; Stepa S.; Hoon D.; Ahn K.; Kang K.J.; Beuschlein F.; Breggia A.; Birrer M.; Bell D.; Borad M.; Bryce A.H.; Castle E.; Chandan V.; Cheville J.; Copland J.A.; Farnell M.; Flotte T.; Giama N.; Ho T.; Kendrick M.; Kocher J.-P.; Kopp K.; Moser C.; Nagorney D.; O'Brien D.; O'Neill B.P.; Patel T.; Petersen G.; Que F.; Rivera M.; Roberts L.; Smallridge R.; Smyrk T.; Stanton M.; Thompson R.H.; Torbenson M.; Yang J.D.; Zhang L.; Brimo F.; Ajani J.A.; Angulo Gonzalez A.M.; Behrens C.; Bondaruk J.; Broaddus R.; Czerniak B.; Esmaeli B.; Fujimoto J.; Gershenwald J.; Guo C.; Lazar A.J.; Logothetis C.; Meric-Bernstam F.; Moran C.; Ramondetta L.; Rice D.; Sood A.; Tamboli P.; Thompson T.; Troncoso P.; Tsao A.; Wistuba I.; Carter C.; Haydu L.; Hersey P.; Jakrot V.; Kakavand H.; Kefford R.; Lee K.; Long G.; Mann G.; Quinn M.; Saw R.; Scolyer R.; Shannon K.; Spillane A.; Stretch J.; Synott M.; Thompson J.; Wilmott J.; Al-Ahmadie H.; Chan T.A.; Ghossein R.; Gopalan A.; Levine D.A.; Reuter V.; Singer S.; Singh B.; Tien N.V.; Broudy T.; Mirsaidi C.; Nair P.; Drwiega P.; Miller J.; Smith J.; Zaren H.; Park J.-W.; Hung N.P.; Kebebew E.; Linehan W.M.; Metwalli A.R.; Pacak K.; Pinto P.A.; Schiffman M.; Schmidt L.S.; Vocke C.D.; Wentzensen N.; Worrell R.; Yang H.; Moncrieff M.; Goparaju C.; Melamed J.; Pass H.; Botnariuc N.; Caraman I.; Cernat M.; Chemencedji I.; Clipca A.; Doruc S.; Gorincioi G.; Mura S.; Pirtac M.; Stancul I.; Tcaciuc D.; Albert M.; Alexopoulou I.; Arnaout A.; Bartlett J.; Engel J.; Gilbert S.; Parfitt J.; Sekhon H.; Thomas G.; Rassl D.M.; Rintoul R.C.; Bifulco C.; Tamakawa R.; Urba W.; Hayward N.; Timmers H.; Antenucci A.; Facciolo F.; Grazi G.; Marino M.; Merola R.; de Krijger R.; Gimenez-Roqueplo A.-P.; Piche A.; Chevalier S.; McKercher G.; Birsoy K.; Barnett G.; Brewer C.; Farver C.; Naska T.; Pennell N.A.; Raymond D.; Schilero C.; Smolenski K.; Williams F.; Morrison C.; Borgia J.A.; Liptay M.J.; Pool M.; Seder C.W.; Junker K.; Omberg L.; Dinkin M.; Manikhas G.; Alvaro D.; Bragazzi M.C.; Cardinale V.; Carpino G.; Gaudio E.; Chesla D.; Cottingham S.; Dubina M.; Moiseenko F.; Dhanasekaran R.; Becker K.-F.; Janssen K.-P.; Slotta-Huspenina J.; Abdel-Rahman M.H.; Aziz D.; Bell S.; Cebulla C.M.; Davis A.; Duell R.; Elder J.B.; Hilty J.; Kumar B.; Lang J.; Lehman N.L.; Mandt R.; Nguyen P.; Pilarski R.; Rai K.; Schoenfield L.; Senecal K.; Wakely P.; Hansen P.; Lechan R.; Powers J.; Tischler A.; Grizzle W.E.; Sexton K.C.; Kastl A.; Henderson J.; Porten S.; Waldmann J.; Fassnacht M.; Asa S.L.; Schadendorf D.; Couce M.; Graefen M.; Huland H.; Sauter G.; Schlomm T.; Simon R.; Tennstedt P.; Olabode O.; Nelson M.; Bathe O.; Carroll P.R.; Chan J.M.; Disaia P.; Glenn P.; Kelley R.K.; Landen C.N.; Phillips J.; Prados M.; Simko J.; Smith-McCune K.; VandenBerg S.; Roggin K.; Fehrenbach A.; Kendler A.; Sifri S.; Steele R.; Jimeno A.; Carey F.; Forgie I.; Mannelli M.; Carney M.; Hernandez B.; Campos B.; Herold-Mende C.; Jungk C.; Unterberg A.; von Deimling A.; Bossler A.; Galbraith J.; Jacobus L.; Knudson M.; Knutson T.; Ma D.; Milhem M.; Sigmund R.; Godwin A.K.; Madan R.; Rosenthal H.G.; Adebamowo C.; Adebamowo S.N.; Boussioutas A.; Beer D.; Giordano T.; Mes-Masson A.-M.; Saad F.; Bocklage T.; Landrum L.; Mannel R.; Moore K.; Moxley K.; Postier R.; Walker J.; Zuna R.; Feldman M.; Valdivieso F.; Dhir R.; Luketich J.; Mora Pinero E.M.; Quintero-Aguilo M.; Carlotti C.G.; Dos Santos J.S.; Kemp R.; Sankarankuty A.; Tirapelli D.; Catto J.; Agnew K.; Swisher E.; Creaney J.; Robinson B.; Shelley C.S.; Godwin E.M.; Kendall S.; Shipman C.; Bradford C.; Carey T.; Haddad A.; Moyer J.; Peterson L.; Prince M.; Rozek L.; Wolf G.; Bowman R.; Fong K.M.; Yang I.; Korst R.; Rathmell W.K.; Fantacone-Campbell J.L.; Hooke J.A.; Kovatich A.J.; Shriver C.D.; DiPersio J.; Drake B.; Govindan R.; Heath S.; Ley T.; Van Tine B.; Westervelt P.; Rubin M.A.; Lee J.I.; Aredes N.D.; Mariamidze A.; Weinstein J.N.1; Mishra L.13; Akbani R.1; Korkut A.20; Zaidi S.32; Kanchi R.S.20; Rao S.32; Gough N.R.32; Schultz A.20; Li X.20; Lorenzi P.L.20; Berger A.C.24; Robertson G.31; Kwong L.N.20; Datto M.21; Roszik J.20; Ling S.20; Ravikumar V.20; Manyam G.20; Rao A.20; Shelley S.30; Liu Y.20; Ju Z.20; Hansel D.28; de Velasco G.34; Pennathur A.33; Andersen J.B.35; O'Rourke C.J.35; Ohshiro K.32; Jogunoori W.32; Nguyen B.-N.32; Li S.20; Osmanbeyoglu H.U.29; Ajani J.A.20; Mani S.A.20; Houseman A.36; Wiznerowicz M.27; Chen J.20; Gu S.32; Ma W.20; Zhang J.20; Tong P.20; Cherniack A.D.24; Deng C.32; Resar L.38; Caesar-Johnson S.J.; Demchok J.A.; Felau I.; Kasapi M.; Ferguson M.L.; Hutter C.M.; Sofia H.J.; Tarnuzzer R.; Wang Z.; Yang L.; Zenklusen J.C.; Zhang J.J.; Chudamani S.; Liu J.; Lolla L.; Naresh R.; Pihl T.; Sun Q.; Wan Y.; Wu Y.; Cho J.; DeFreitas T.; Frazer S.; Gehlenborg N.; Getz G.; Heiman D.I.; Kim J.; Lawrence M.S.; Lin P.; Meier S.; Noble M.S.; Saksena G.; Voet D.; Zhang H.; Bernard B.; Chambwe N.; Dhankani V.; Knijnenburg T.; Kramer R.; Leinonen K.; Liu Y.; Miller M.; Reynolds S.; Shmulevich I.; Thorsson V.; Zhang W.; Akbani R.; Broom B.M.; Hegde A.M.; Ju Z.; Kanchi R.S.; Korkut A.; Li J.; Liang H.; Ling S.; Liu W.; Lu Y.; Mills G.B.; Ng K.-S.; Rao A.; Ryan M.; Wang J.; Weinstein J.N.; Zhang J.; Abeshouse A.; Armenia J.; Chakravarty D.; Chatila W.K.; de Bruijn I.; Gao J.; Gross B.E.; Heins Z.J.; Kundra R.; La K.; Ladanyi M.; Luna A.; Nissan M.G.; Ochoa A.; Phillips S.M.; Reznik E.; Sanchez-Vega F.; Sander C.; Schultz N.; Sheridan R.; Sumer S.O.; Sun Y.; Taylor B.S.; Wang J.; Zhang H.; Anur P.; Peto M.; Spellman P.; Benz C.; Stuart J.M.; Wong C.K.; Yau C.; Hayes D.N.; Parker J.S.; Wilkerson M.D.; Ally A.; Balasundaram M.; Bowlby R.; Brooks D.; Carlsen R.; Chuah E.; Dhalla N.; Holt R.; Jones S.J.M.; Kasaian K.; Lee D.; Ma Y.; Marra M.A.; Mayo M.; Moore R.A.; Mungall A.J.; Mungall K.; Robertson A.G.; Sadeghi S.; Schein J.E.; Sipahimalani P.; Tam A.; Thiessen N.; Tse K.; Wong T.; Berger A.C.; Beroukhim R.; Cherniack A.D.; Cibulskis C.; Gabriel S.B.; Gao G.F.; Ha G.; Meyerson M.; Schumacher S.E.; Shih J.; Kucherlapati M.H.; Kucherlapati R.S.; Baylin S.; Cope L.; Danilova L.; Bootwalla M.S.; Lai P.H.; Maglinte D.T.; Van Den Berg D.J.; Weisenberger D.J.; Auman J.T.; Balu S.; Bodenheimer T.; Fan C.; Hoadley K.A.; Hoyle A.P.; Jefferys S.R.; Jones C.D.; Meng S.; Mieczkowski P.A.; Mose L.E.; Perou A.H.; Perou C.M.; Roach J.; Shi Y.; Simons J.V.; Skelly T.; Soloway M.G.; Tan D.; Veluvolu U.; Fan H.; Hinoue T.; Laird P.W.; Shen H.; Zhou W.; Bellair M.; Chang K.; Covington K.; Creighton C.J.; Dinh H.; Doddapaneni H.; Donehower L.A.; Drummond J.; Gibbs R.A.; Glenn R.; Hale W.; Han Y.; Hu J.; Korchina V.; Lee S.; Lewis L.; Li W.; Liu X.; Morgan M.; Morton D.; Muzny D.; Santibanez J.; Sheth M.; Shinbrot E.; Wang L.; Wang M.; Wheeler D.A.; Xi L.; Zhao F.; Hess J.; Appelbaum E.L.; Bailey M.; Cordes M.G.; Ding L.; Fronick C.C.; Fulton L.A.; Fulton R.S.; Kandoth C.; Mardis E.R.; McLellan M.D.; Miller C.A.; Schmidt H.K.; Wilson R.K.; Crain D.; Curley E.; Gardner J.; Lau K.; Mallery D.; Morris S.; Paulauskis J.; Penny R.; Shelton C.; Shelton T.; Sherman M.; Thompson E.; Yena P.; Bowen J.; Gastier-Foster J.M.; Gerken M.; Leraas K.M.; Lichtenberg T.M.; Ramirez N.C.; Wise L.; Zmuda E.; Corcoran N.; Costello T.; Hovens C.; Carvalho A.L.; de Carvalho A.C.; Fregnani J.H.; Longatto-Filho A.; Reis R.M.; Scapulatempo-Neto C.; Silveira H.C.S.; Vidal D.O.; Burnette A.; Eschbacher J.; Hermes B.; Noss A.; Singh R.; Anderson M.L.; Castro P.D.; Ittmann M.; Huntsman D.; Kohl B.; Le X.; Thorp R.; Andry C.; Duffy E.R.; Lyadov V.; Paklina O.; Setdikova G.; Shabunin A.; Tavobilov M.; McPherson C.; Warnick R.; Berkowitz R.; Cramer D.; Feltmate C.; Horowitz N.; Kibel A.; Muto M.; Raut C.P.; Malykh A.; Barnholtz-Sloan J.S.; Barrett W.; Devine K.; Fulop J.; Ostrom Q.T.; Shimmel K.; Wolinsky Y.; Sloan A.E.; De Rose A.; Giuliante F.; Goodman M.; Karlan B.Y.; Hagedorn C.H.; Eckman J.; Harr J.; Myers J.; Tucker K.; Zach L.A.; Deyarmin B.; Hu H.; Kvecher L.; Larson C.; Mural R.J.; Somiari S.; Vicha A.; Zelinka T.; Bennett J.; Iacocca M.; Rabeno B.; Swanson P.; Latour M.; Lacombe L.; Tetu B.; Bergeron A.; McGraw M.; Staugaitis S.M.; Chabot J.; Hibshoosh H.; Sepulveda A.; Su T.; Wang T.; Potapova O.; Voronina O.; Desjardins L.; Mariani O.; Roman-Roman S.; Sastre X.; Stern M.-H.; Cheng F.; Signoretti S.; Berchuck A.; Bigner D.; Lipp E.; Marks J.; McCall S.; McLendon R.; Secord A.; Sharp A.; Behera M.; Brat D.J.; Chen A.; Delman K.; Force S.; Khuri F.; Magliocca K.; Maithel S.; Olson J.J.; Owonikoko T.; Pickens A.; Ramalingam S.; Shin D.M.; Sica G.; Van Meir E.G.; Zhang H.; Eijckenboom W.; Gillis A.; Korpershoek E.; Looijenga L.; Oosterhuis W.; Stoop H.; van Kessel K.E.; Zwarthoff E.C.; Calatozzolo C.; Cuppini L.; Cuzzubbo S.; DiMeco F.; Finocchiaro G.; Mattei L.; Perin A.; Pollo B.; Chen C.; Houck J.; Lohavanichbutr P.; Hartmann A.; Stoehr C.; Stoehr R.; Taubert H.; Wach S.; Wullich B.; Kycler W.; Murawa D.; Wiznerowicz M.; Chung K.; Edenfield W.J.; Martin J.; Baudin E.; Bubley G.; Bueno R.; De Rienzo A.; Richards W.G.; Kalkanis S.; Mikkelsen T.; Noushmehr H.; Scarpace L.; Girard N.; Aymerich M.; Campo E.; Gine E.; Guillermo A.L.; Van Bang N.; Hanh P.T.; Phu B.D.; Tang Y.; Colman H.; Evason K.; Dottino P.R.; Martignetti J.A.; Gabra H.; Juhl H.; Akeredolu T.; Stepa S.; Hoon D.; Ahn K.; Kang K.J.; Beuschlein F.; Breggia A.; Birrer M.; Bell D.; Borad M.; Bryce A.H.; Castle E.; Chandan V.; Cheville J.; Copland J.A.; Farnell M.; Flotte T.; Giama N.; Ho T.; Kendrick M.; Kocher J.-P.; Kopp K.; Moser C.; Nagorney D.; O'Brien D.; O'Neill B.P.; Patel T.; Petersen G.; Que F.; Rivera M.; Roberts L.; Smallridge R.; Smyrk T.; Stanton M.; Thompson R.H.; Torbenson M.; Yang J.D.; Zhang L.; Brimo F.; Ajani J.A.; Angulo Gonzalez A.M.; Behrens C.; Bondaruk J.; Broaddus R.; Czerniak B.; Esmaeli B.; Fujimoto J.; Gershenwald J.; Guo C.; Lazar A.J.; Logothetis C.; Meric-Bernstam F.; Moran C.; Ramondetta L.; Rice D.; Sood A.; Tamboli P.; Thompson T.; Troncoso P.; Tsao A.; Wistuba I.; Carter C.; Haydu L.; Hersey P.; Jakrot V.; Kakavand H.; Kefford R.; Lee K.; Long G.; Mann G.; Quinn M.; Saw R.; Scolyer R.; Shannon K.; Spillane A.; Stretch J.; Synott M.; Thompson J.; Wilmott J.; Al-Ahmadie H.; Chan T.A.; Ghossein R.; Gopalan A.; Levine D.A.; Reuter V.; Singer S.; Singh B.; Tien N.V.; Broudy T.; Mirsaidi C.; Nair P.; Drwiega P.; Miller J.; Smith J.; Zaren H.; Park J.-W.; Hung N.P.; Kebebew E.; Linehan W.M.; Metwalli A.R.; Pacak K.; Pinto P.A.; Schiffman M.; Schmidt L.S.; Vocke C.D.; Wentzensen N.; Worrell R.; Yang H.; Moncrieff M.; Goparaju C.; Melamed J.; Pass H.; Botnariuc N.; Caraman I.; Cernat M.; Chemencedji I.; Clipca A.; Doruc S.; Gorincioi G.; Mura S.; Pirtac M.; Stancul I.; Tcaciuc D.; Albert M.; Alexopoulou I.; Arnaout A.; Bartlett J.; Engel J.; Gilbert S.; Parfitt J.; Sekhon H.; Thomas G.; Rassl D.M.; Rintoul R.C.; Bifulco C.; Tamakawa R.; Urba W.; Hayward N.; Timmers H.; Antenucci A.; Facciolo F.; Grazi G.; Marino M.; Merola R.; de Krijger R.; Gimenez-Roqueplo A.-P.; Piche A.; Chevalier S.; McKercher G.; Birsoy K.; Barnett G.; Brewer C.; Farver C.; Naska T.; Pennell N.A.; Raymond D.; Schilero C.; Smolenski K.; Williams F.; Morrison C.; Borgia J.A.; Liptay M.J.; Pool M.; Seder C.W.; Junker K.; Omberg L.; Dinkin M.; Manikhas G.; Alvaro D.; Bragazzi M.C.; Cardinale V.; Carpino G.; Gaudio E.; Chesla D.; Cottingham S.; Dubina M.; Moiseenko F.; Dhanasekaran R.; Becker K.-F.; Janssen K.-P.; Slotta-Huspenina J.; Abdel-Rahman M.H.; Aziz D.; Bell S.; Cebulla C.M.; Davis A.; Duell R.; Elder J.B.; Hilty J.; Kumar B.; Lang J.; Lehman N.L.; Mandt R.; Nguyen P.; Pilarski R.; Rai K.; Schoenfield L.; Senecal K.; Wakely P.; Hansen P.; Lechan R.; Powers J.; Tischler A.; Grizzle W.E.; Sexton K.C.; Kastl A.; Henderson J.; Porten S.; Waldmann J.; Fassnacht M.; Asa S.L.; Schadendorf D.; Couce M.; Graefen M.; Huland H.; Sauter G.; Schlomm T.; Simon R.; Tennstedt P.; Olabode O.; Nelson M.; Bathe O.; Carroll P.R.; Chan J.M.; Disaia P.; Glenn P.; Kelley R.K.; Landen C.N.; Phillips J.; Prados M.; Simko J.; Smith-McCune K.; VandenBerg S.; Roggin K.; Fehrenbach A.; Kendler A.; Sifri S.; Steele R.; Jimeno A.; Carey F.; Forgie I.; Mannelli M.; Carney M.; Hernandez B.; Campos B.; Herold-Mende C.; Jungk C.; Unterberg A.; von Deimling A.; Bossler A.; Galbraith J.; Jacobus L.; Knudson M.; Knutson T.; Ma D.; Milhem M.; Sigmund R.; Godwin A.K.; Madan R.; Rosenthal H.G.; Adebamowo C.; Adebamowo S.N.; Boussioutas A.; Beer D.; Giordano T.; Mes-Masson A.-M.; Saad F.; Bocklage T.; Landrum L.; Mannel R.; Moore K.; Moxley K.; Postier R.; Walker J.; Zuna R.; Feldman M.; Valdivieso F.; Dhir R.; Luketich J.; Mora Pinero E.M.; Quintero-Aguilo M.; Carlotti C.G.; Dos Santos J.S.; Kemp R.; Sankarankuty A.; Tirapelli D.; Catto J.; Agnew K.; Swisher E.; Creaney J.; Robinson B.; Shelley C.S.; Godwin E.M.; Kendall S.; Shipman C.; Bradford C.; Carey T.; Haddad A.; Moyer J.; Peterson L.; Prince M.; Rozek L.; Wolf G.; Bowman R.; Fong K.M.; Yang I.; Korst R.; Rathmell W.K.; Fantacone-Campbell J.L.; Hooke J.A.; Kovatich A.J.; Shriver C.D.; DiPersio J.; Drake B.; Govindan R.; Heath S.; Ley T.; Van Tine B.; Westervelt P.; Rubin M.A.; Lee J.I.; Aredes N.D.; Mariamidze A.; Weinstein J.N.20; Mishra L.32; Akbani R.20
2018-10-24
Source PublicationCell Systems
ISSN24054720 24054712
Volume7Issue:4Pages:422-437.e7
Abstract

We present an integromic analysis of gene alterations that modulate transforming growth factor β (TGF-β)-Smad-mediated signaling in 9,125 tumor samples across 33 cancer types in The Cancer Genome Atlas (TCGA). Focusing on genes that encode mediators and regulators of TGF-β signaling, we found at least one genomic alteration (mutation, homozygous deletion, or amplification) in 39% of samples, with highest frequencies in gastrointestinal cancers. We identified mutation hotspots in genes that encode TGF-β ligands (BMP5), receptors (TGFBR2, AVCR2A, and BMPR2), and Smads (SMAD2 and SMAD4). Alterations in the TGF-β superfamily correlated positively with expression of metastasis-associated genes and with decreased survival. Correlation analyses showed the contributions of mutation, amplification, deletion, DNA methylation, and miRNA expression to transcriptional activity of TGF-β signaling in each cancer type. This study provides a broad molecular perspective relevant for future functional and therapeutic studies of the diverse cancer pathways mediated by the TGF-β superfamily. To date, there are no studies of the TGF-β superfamily of signaling pathways across multiple cancers. This study represents a key starting point for unraveling the role of this complex superfamily in 33 divergent cancer types from over 9,000 patients.

KeywordCancer Dna Methylation Microrna Mutation Hotspot Pan-cancer Tcga Tgf-β Tgf-β Pathway The Cancer Genome Atlas Transcription
DOI10.1016/j.cels.2018.08.010
URLView the original
Indexed BySCI
Language英语
WOS Research AreaBiochemistry & Molecular Biology ; Cell Biology
WOS SubjectBiochemistry & Molecular Biology ; Cell Biology
WOS IDWOS:000448230400009
Fulltext Access
Citation statistics
Cited Times [WOS]:8   [WOS Record]     [Related Records in WOS]
Document TypeJournal article
CollectionFaculty of Health Sciences
Corresponding AuthorMishra L.; Akbani R.
Affiliation1.University of Texas MD Anderson Cancer Center
2.Duke School of Medicine
3.Greater Poland Cancer Center
4.International Institute for Molecular Oncology
5.Broad Institute
6.Hospital Universitario 12 de Octubre
7.VA Medical Center
8.Poznan University of Medical Sciences
9.University of California, San Diego
10.Memorial Sloan-Kettering Cancer Center
11.University of Wisconsin School of Medicine and Public Health
12.British Columbia Cancer Agency
13.George Washington University
14.University of Pittsburgh School of Medicine
15.Dana-Farber Cancer Institute
16.Københavns Universitet
17.Oregon State University
18.Universidade de Macau
19.The Johns Hopkins School of Medicine
20.University of Texas MD Anderson Cancer Center
21.Duke School of Medicine
22.Greater Poland Cancer Center
23.International Institute for Molecular Oncology
24.Broad Institute
25.Hospital Universitario 12 de Octubre
26.VA Medical Center
27.Poznan University of Medical Sciences
28.University of California, San Diego
29.Memorial Sloan-Kettering Cancer Center
30.University of Wisconsin School of Medicine and Public Health
31.British Columbia Cancer Agency
32.George Washington University
33.University of Pittsburgh School of Medicine
34.Dana-Farber Cancer Institute
35.Københavns Universitet
36.Oregon State University
37.Universidade de Macau
38.The Johns Hopkins School of Medicine
Recommended Citation
GB/T 7714
Korkut A.,Zaidi S.,Kanchi R.S.,et al. A Pan-Cancer Analysis Reveals High-Frequency Genetic Alterations in Mediators of Signaling by the TGF-β Superfamily[J]. Cell Systems,2018,7(4):422-437.e7.
APA Korkut A..,Zaidi S..,Kanchi R.S..,Rao S..,Gough N.R..,...&Akbani R..(2018).A Pan-Cancer Analysis Reveals High-Frequency Genetic Alterations in Mediators of Signaling by the TGF-β Superfamily.Cell Systems,7(4),422-437.e7.
MLA Korkut A.,et al."A Pan-Cancer Analysis Reveals High-Frequency Genetic Alterations in Mediators of Signaling by the TGF-β Superfamily".Cell Systems 7.4(2018):422-437.e7.
Related Services
Recommend this item
Bookmark
Usage statistics
Export to Endnote
Google Scholar
Similar articles in Google Scholar
[Korkut A.]'s Articles
[Zaidi S.]'s Articles
[Kanchi R.S.]'s Articles
Baidu academic
Similar articles in Baidu academic
[Korkut A.]'s Articles
[Zaidi S.]'s Articles
[Kanchi R.S.]'s Articles
Bing Scholar
Similar articles in Bing Scholar
[Korkut A.]'s Articles
[Zaidi S.]'s Articles
[Kanchi R.S.]'s Articles
Terms of Use
No data!
Social Bookmark/Share
All comments (0)
No comment.
 

Items in the repository are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.